Grâce aux efforts de la nouvelle génération de soldats, Kafka parvient à temps pour sauver Mina Ashiro des griffes de Kaiju N° 9. De plus, il possède une multitude de techniques de combat améliorées, inspirées des Forces de Défense, adaptées à son ennemi. Mais avec l'accès d'Isao Shinomiya et de ses vastes connaissances en arts martiaux, les techniques de combat raffinées de Kafka auront-elles une chance ?